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Aislamiento de Mycobacterium intracellulare a partir de un pulmón bovino comercializado en una carnicería de la zona oeste del conurbano bonaerense InVet
Marfil,MJ; Garbaccio,SG; Huertas,PG; Barandiaran,S; Alonso,B; Zumárraga,MJ.
Se realizó un muestreo de 62 pulmones bovinos en una carnicería y un frigorífico de la zona oeste del conurbano bonaerense. De uno de ellos, adquirido en una carnicería, y sin lesiones visibles compatibles con tuberculosis, se obtuvo por cultivo en medio Stonebrink desarrollo de bacilos ácido alcohol resistentes. Por polymerase chain reaction restriction analysis y secuenciación del gen que codifica 16S ARN ribosomal se identificó Mycobacterium avium subsp. intracellulare. Esta especie pertenece al complejo Mycobacterium avium y es considerada una micobacteria oportunista ya que normalmente no produce signos clínicos, aunque ha sido aislada de mamíferos enfermos. Este hallazgo en un pulmón bovino nos alerta sobre el potencial riesgo de transmisión a...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Mycobacterium intracellulare; Reacción en cadena de la polimerasa; Tipificación molecular.
Ano: 2016 URL: http://www.scielo.org.ar/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1668-34982016000100003
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Aseguramiento de Calidad en el Laboratorio de Biología Molecular: Control de Contaminación Ambiental ABCL
Amigo,Quillen; Garbarello,María Florencia; Otarola,Eliana Maricel; Nardi,María Amelia; Frecha,Cecilia Ariana; Furci,Aida; Oyhamburu,José.
La reacción en cadena de la polimerasa (PCR) es la técnica más importante en Biología Molecular. Su principal deficiencia es la susceptibilidad a la contaminación de la muestra, ya sea con productos de amplificación generados en reacciones previas o con material genético proveniente de otras muestras. Se entiende por contaminación a la presencia indeseada de moléculas de ADN o ARN, que pueden actuar como templados en reacciones de amplificación. El objetivo del trabajo fue demostrar la importancia de la implementación de un control de contaminación ambiental periódico monitoreando la integridad del circuito de PCR. Para ello, se hisoparon puntos correspondientes a diferentes áreas de trabajo y se investigó la presencia de amplicones mediante PCR Real Time...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Reacción en cadena de la polimerasa; Circuito de PCR; Contaminación por amplicones; Buenas prácticas de laboratorio; Laboratorio de biología molecular.
Ano: 2018 URL: http://www.scielo.org.ar/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0325-29572018000200005
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CARACTERIZACIÓN MOLECULAR DE UN NUEVO BEGOMOVIRUS AISLADO DE CINCO ESPECIES DE ARVENSES COLECTADAS EN CULTIVOS DE TOMATE EN VALLE DEL CAUCA Acta biol.Colomb.
LÓPEZ-LÓPEZ,Karina; JARA-TEJADA,Frenyiline; VACA-VACA,Juan Carlos.
RESUMEN Las arvenses son hospederos alternos de begomovirus (Geminiviridae), los cuales facilitan su persistencia y propagación a cultivos de interés agronómico, como el tomate. El objetivo de esta investigación fue obtener el genoma completo de un begomovirus bipartita encontrado en Amaranthus dubius, Rivina humilis, Rhynchosia minima, Desmodium sp. y Caesalpinia sp., las cuales fueron colectadas en cultivos de tomate en Ginebra y Cerrito, Valle del Cauca. El genoma del begomovirus fue obtenido utilizando amplificación por círculo rodante y digestión con las enzimas EcoRI y EcoRV, las cuáles cortan el componente genómico A y B, respectivamente. Estos fragmentos fueron clonados, secuenciados y analizados. Finalmente, se verificó la presencia de este...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Geminivirus; Mosca blanca; Reacción en cadena de la polimerasa; Solanaceae.
Ano: 2019 URL: http://www.scielo.org.co/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0120-548X2019000300528
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Desarrollo y validación de una PCR múltiple para el diagnóstico de Bordetella spp. ABCL
Pianciola,Luis Alfredo; Leonor Mazzeo,Melina; Flores,Darío; Hozbor,Daniela Flavia.
El objetivo del trabajo consistió en diseñar y validar una PCR en formato convencional que permita confirmar la presencia o ausencia de Bordetella pertussis y detectar otras especies del género, como Bordetella parapertussis y Bordetella bronchiseptica, que pudieran estar involucradas en el cuadro clínico de coqueluche. A tal fin se diseñó una reacción en cadena de la polimerasa (PCR) múltiple que amplifica una secuencia del promotor del gen de Toxina Pertussis y otra del gen de la Toxina Adenilato Ciclasa-Hemolisina. Se validó la metodología siguiendo esquemas publicados anteriormente. Se optimizaron las condiciones de la PCR. Se validó la metodología obteniéndose un límite de detección para ambas secuencias de 0,5 bacterias por reacción. Se validó,...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Bordetella pertussis; Bordetella parapertussis; Bordetella bronchiseptica; Reacción en cadena de la polimerasa.
Ano: 2012 URL: http://www.scielo.org.ar/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0325-29572012000400010
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Diversidad de ß-lactamasas en aislamientos clínicos de enterobacterias ABCL
Casabonne,Cecilia; Pérez,Jorgelina; Balagué,Claudia; Fernández,Luisa.
La rápida emergencia de resistencia a antimicrobianos debida a la presencia de b-lactamasas de espectro extendido (BLEE) tiene un impacto significativo en la salud pública. Las BLEEs son enzimas producidas por bacilos gramnegativos y confieren resistencia a las penicilinas, a todas las cefalosporinas y al aztreonam, pero no a los carbapenemes ni a las cefamicinas y la mayoría son inhibidas por el ácido clavulánico. El objetivo de este trabajo fue evaluar la resistencia a antibióticos b-lactámicos en aislamientos de Klebsiella pneumoniae, Escherichia coli y Proteus mirabilis y caracterizar las b-lactamasas responsables de dicha resistencia. Se analizaron 2.030 aislamientos (362 Klebsiella pneumoniae, 1.250 Escherichia coli y 175 Proteus mirabilis)...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: SS-lactamasas de espectro extendido; Enterobacteriaceae; Reacción en cadena de la polimerasa.
Ano: 2012 URL: http://www.scielo.org.ar/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0325-29572012000300009
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Estudio en caninos de zonas urbanas de Tandil como posibles portadores de Escherichia coli verocitotoxigénicos InVet
Fernández,D; Etcheverría,A. I.; Padola,N. L.; Parma,A. E..
Sesenta perros de zonas urbanas fueron estudiados con el objetivo de determinar si con los hábitos de higiene y alimentación que reciben estos animales, pueden constituir un riesgo para la salud pública como portadores de Escherichia coli verocitotoxigénicos. Se tomaron muestras de hisopados rectales de cada perro que luego fueron sembradas en medios apropiados para su posterior procesamiento. Se utilizó la técnica de reacción en cadena de la polimerasa a partir de la zona de crecimiento confluente para rastrear los genes que codifican para las verocitotoxinas tipo 1 y 2, no detectándolos en ninguna de las muestras estudiadas. Estos resultados podrían deberse a que los cuidados que se tienen con perros de zonas urbanas permitirían reducir el posible...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Escherichia coli verocitotoxigénico; Perros; Reacción en cadena de la polimerasa; Síndrome urémico hemolítico.
Ano: 2006 URL: http://www.scielo.org.ar/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1668-34982006000100010
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EVALUACIÓN DE DOS MÉTODOS DE EXTRACCIÓN DE ADN A PARTIR DE BIOPSIAS FIJADAS EN FORMALINA Y EMBEBIDAS EN PARAFINA EN CONDICIONES NO ÓPTIMAS Acta biol.Colomb.
BUSTAMANTE,JAVIER ANDRÉS; ASTUDILLO,MIRYAM; PAZOS,ALVARO JAIRO; BRAVO,LUIS EDUARDO.
Los tejidos de archivo son material de incalculable valor para estudios retrospectivos que requieran la aplicación de análisis moleculares. Existen múltiples métodos de extracción de ADN a partir de este tipo de muestras. No obstante, la mayoría de métodos toman mucho tiempo y los reactivos empleados contribuyen a la fragmentación del ADN. Con el objetivo de optimizar dos métodos de extracción de ADN a partir de tejidos embebidos en parafina en condiciones no óptimas, se seleccionaron 47 bloques en parafina que contenían biopsias de pleura, pulmón y pericardio correspondientes a 24 pacientes (66,6% hombres) mayores de 18 años, con inflamación granulomatosa crónica, remitidos al Departamento de Patología, Hospital Universitario del Valle entre 2002 y 2007....
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Biopsia; Granuloma; Ácidos nucleicos; Fragmentación del ADN; Reacción en cadena de la polimerasa.
Ano: 2011 URL: http://www.scielo.org.co/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0120-548X2011000200007
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Identificación de un aislamiento del grupo 16SrIII, Candidatus Phytoplasma pruni en plantas y semillas de amaranto (Amaranthus hypochondriacus L.) en México Agrociencia
Rojas-Martínez,Reyna I.; Zavaleta-Mejía,Emma; Lee,Ing-Ming; Aragón-García,Agustín.
Recientemente en el estado de Tlaxcala, México el "síntoma de escoba de bruja" (proliferación de brotes y reducción de entrenudos) fue observado en amaranto (Amaranthus hypochondriacus L.). Esta sintomatología en campo se distribuye uniformemente en la plantación y no en forma azarosa y de manchones; además, el mayor daño es en la panícula que aloja a las semillas lo cual genera considerables perdidas en la cosecha. Por tanto, el objetivo del presente trabajo fue determinar la presencia de fitoplasmas en plantas con síntomas de escoba de bruja y en semillas provenientes de plantas enfermas. En todas las muestras procesadas se encontró asociado un fitoplasma perteneciente al grupo 16Sr III, según los resultados de la comparación de los patrones generados...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Amaranthus; Candidatus Phytoplasma pruni; Reacción en cadena de la polimerasa; RFLP.
Ano: 2009 URL: http://www.scielo.org.mx/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1405-31952009000800008
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Inmunoserología y métodos moleculares para el diagnóstico de Chagas: revisión sistemática rápida ABCL
Gonzalez,Lucas; Scollo,Karenina; Bardach,Ariel; Sáez-Alquezar,Amadeo; Ferlín,Carina; Albajar-Viñas,Pedro; Ciapponi,Agustín; Sosa-Estani,Sergio.
Con el objetivo de incrementar la precisión diagnóstica, la Organización Mundial de la Salud recomienda la realización de dos o más pruebas inmunoserológicas para el diagnóstico de la enfermedad de Chagas en etapa crónica. El objetivo de este trabajo fue realizar una revisión sistemática rápida acerca del desempeño de las técnicas inmunoserológicas y métodos moleculares en la población general. Se identificaron 178 estudios de los cuales fueron incluidos nueve. Las técnicas de ELISA mostraron la mayor sensibilidad (82-98%) y especificidad (96-100%). Los métodos rápidos mostraron valores de sensibilidad entre 88-93% y especificidad 97- 100%, mientras que los métodos moleculares (PCR) presentaron niveles muy variables de sensibilidad (22-92%) y especificidad...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Chagas; Diagnóstico; Sensibilidad; Especificidad; Reacción en cadena de la polimerasa; Ensayo inmunoenzimático ELISA; Inmunofluorescencia indirecta; Hemaglutinación indirecta.
Ano: 2017 URL: http://www.scielo.org.ar/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0325-29572017000100010
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Meta-análisis: diagnóstico de tuberculosis resistente por técnicas no comerciales de amplificación ABCL
Imperiale,Belén Rocío.
La emergencia de tuberculosis (TB) multidrogo y extensivamente-resistente reactivó la necesidad de contar con métodos rápidos para detectar resistencia a isoniacida (INH) y rifampicina (RIF). Por tal motivo, los objetivos de este trabajo fueron evaluar, mediante meta-análisis, la exactitud global y la posible utilidad de métodos caseros basados en PCR para la detección rápida de resistencia a INH y RIF en aislamientos clínicos de Mycobacterium tuberculosis. La búsqueda bibliográfica incluyó Medline/PubMed, BioMedLib. Para estimar la variabilidad entre los resultados de los estudios y el grado de exactitud diagnóstica de los métodos utilizados se realizaron gráficos "forest plot" y curvas SROC (summary receiver operating characteristic) mediante el software...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Mycobacterium tuberculosis; Tuberculosis; Sensibilidad a drogas; Rifampicina; Isoniacida; Métodos moleculares; Reacción en cadena de la polimerasa; Métodos rápidos.
Ano: 2013 URL: http://www.scielo.org.ar/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0325-29572013000200017
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Obtención de ADN polimerasa de Thermus aquaticus en un laboratorio de mediana complejidad ABCL
Pérez,Fernando; Baridón,María de los Ángeles; Henen,Jaime; Venegoni,Graciela.
La PCR (reacción en cadena de la polimerasa) es una técnica de diagnóstico molecular muy sensible, capaz de revelar tan sólo una copia de ADN en una mezcla compleja del mismo. El punto central para la difusión de esta metodología fue el descubrimiento de una ADN polimerasa estable al calor aislada de Thermus aquaticus (taq ADN pol), lo cual permitió automatizar el proceso de PCR usando un ciclador térmico, sin la necesidad de una adición continua de ADN polimerasa fresca. El objetivo del trabajo fue adaptar un método para la obtención de taq ADN pol en un laboratorio hospitalario de mediana complejidad usando el equipamiento y los medios de cultivo disponibles. Con este método se consiguió producir un extracto crudo de 10.000 unidades de enzima, de fácil...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Thermus aquaticus; ADN polimerasa; Reacción en cadena de la polimerasa.
Ano: 2006 URL: http://www.scielo.org.ar/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0325-29572006000400013
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PRIMER REPORTE DE BEGOMOVIRUS INFECTANDO CULTIVOS DE AJÍ (Capsicum spp.) EN COLOMBIA Acta biol.Colomb.
VACA-VACA,Juan Carlos; MORALES-EUSE,Jonathan; RIVERA-TORO,Diana Marcela; LÓPEZ-LÓPEZ,Karina.
RESUMEN Virus del género Begomovirus infectan cultivos de importancia económica en todo el mundo, incluyendo ají. A la fecha, en Colombia no hay reportes de la presencia de begomovirus infectando este cultivo, por lo que el objetivo de esta investigación fue identificar la presencia de virus de este género en ají empleando estrategias moleculares. Se colectaron 197 muestras de ají en diez municipios del Valle del Cauca. Se extrajo el DNA genómico total vegetal y mediante PCR se detectó la presencia de begomovirus. Para establecer la identidad molecular del virus se amplificaron fragmentos de 1,4 kb de muestras colectadas en Palmira y Vijes. Los fragmentos fueron clonados, secuenciados y analizados. Se encontró que el 85,7 % de las muestras de ají evaluadas...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Diagnóstico molecular; Geminivirus; Mosca blanca; Reacción en cadena de la polimerasa; Solanaceae.
Ano: 2019 URL: http://www.scielo.org.co/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0120-548X2019000300452
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Relación de fitoplasmas, bactericera cockerelli y geminivirus con el síndrome del declanamiento del jitomate Colegio de Postgraduados
García Tapia, Francisco.
En los últimos años en las zonas productoras de jitomate en el país, se ha observado un síndrome en el cultivo, relacionado con la presencia del insecto Bactericera cockerelli y fitoplasmas; pero además los geminivirus podrían estar también involucrados en el desarrollo de dicho síndrome. Las plantas de jitomate con síntomas fueron colectadas en Ixtlahuaca, Chapingo y Montecillo, Estado de México, Tlayacapan y Zacatepec, Morelos, y Sayula, Jalisco; las muestras de tejido de plantas de jitomate de Ixtlahuaca y Sayula mostraron fluorescencia en tejido del floema al teñirlas con DAPI (4', 6-Diamidino-2-fenilindol diclorhidrato), lo que sugirió la presencia de fitoplasmas en plantas de jitomate con síntomas de amarillamiento de hojas y acortamiento de...
Tipo: Tesis Palavras-chave: Aster yellows; Tínción con DAPI; Reacción en cadena de la polimerasa; Tomato chino La Paz; Tomato severe leaf curl virus.; Maestría; Fitopatología; Aster yellows; DAPI died; Polymerase Chain reaction; Tomato chino La Paz; Tomato severe leaf curl virus.
Ano: 2007 URL: http://hdl.handle.net/10521/1389
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Relación de fitoplasmas, bactericera cockerelli y geminivirus con el síndrome del declanamiento del jitomate Colegio de Postgraduados
García Tapia, Francisco.
En los últimos años en las zonas productoras de jitomate en el país, se ha observado un síndrome en el cultivo, relacionado con la presencia del insecto Bactericera cockerelli y fitoplasmas; pero además los geminivirus podrían estar también involucrados en el desarrollo de dicho síndrome. Las plantas de jitomate con síntomas fueron colectadas en Ixtlahuaca, Chapingo y Montecillo, Estado de México, Tlayacapan y Zacatepec, Morelos, y Sayula, Jalisco; las muestras de tejido de plantas de jitomate de Ixtlahuaca y Sayula mostraron fluorescencia en tejido del floema al teñirlas con DAPI (4', 6-Diamidino-2-fenilindol diclorhidrato), lo que sugirió la presencia de fitoplasmas en plantas de jitomate con síntomas de amarillamiento de hojas y acortamiento de...
Tipo: Tesis Palavras-chave: Aster yellows; Tínción con DAPI; Reacción en cadena de la polimerasa; Tomato chino La Paz; Tomato severe leaf curl virus. Aster yellows; DAPI died; Polymerase Chain reaction; Tomato chino La Paz; Tomato severe leaf curl virus.
Ano: 2012 URL: http://hdl.handle.net/10521/1059
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